Є кілька причин, чому тест RT-PCR може призвести до помилково позитивного результату. Shutterstock

Дві випадки захворювання на COVID-19, раніше пов’язані з поточним спалахом захворювання в Мельбурні, зараз були перекласифікований як помилкові спрацьовування.

Вони більше не включені до офіційного підрахунку справ Вікторії, тоді як низка сайтів опромінення, пов’язаних із цими справами, були видалені.

Основним та «золотим стандартом» тесту для виявлення SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19, є тест на зворотну транскриптазу з полімеразною реакцією (RT-PCR).

Тест RT-PCR є дуже специфічним. Тобто, якщо хтось справді не заражений, існує велика ймовірність, що тест вийде негативним. Тест також дуже чутливий. Отже, якщо хтось справді інфікований вірусом, існує велика ймовірність, що тест повернеться позитивним.

Але незважаючи на те, що тест є дуже специфічним, це все одно залишає невеликий шанс тому, хто не заразився інфекцією, повернути позитивний результат тесту. Це те, що мається на увазі під "помилково позитивним".

По-перше, як працює тест RT-PCR?

Хоча у вік COVID більшість людей чули про тест ПЛР, Як це працює це, зрозуміло, трохи загадка.

Коротше кажучи, після того, як мазок взяли з носа та горла, хімічні речовини використовуються для вилучення РНК (рибуноклеїнової кислоти, різновиду генетичного матеріалу) із зразка. Сюди входять звичайні РНК та РНК людини від вірусу SARS-CoV-2, якщо вони є.

Потім ця РНК перетворюється на дезоксирибонуклеїнову кислоту (ДНК) - ось що означає біт "зворотної транскриптази". Для виявлення вірусу посилюються крихітні сегменти ДНК. За допомогою якогось спеціального флуоресцентного барвника зразок ідентифікується як позитивний чи негативний на основі яскравості флуоресценції після 35 і більше циклів ампліфікації.

Що спричиняє хибнопозитивні результати?

Команда основні причини для хибнопозитивних результатів - це лабораторна помилка та нецільова реакція (тобто тестова перехресна реакція з чимось, що не є ГРВІ-CoV-2).

Лабораторні помилки включають канцелярську помилку, тестування неправильної проби, перехресне забруднення чужою позитивною пробою або проблеми з використовуваними реагентами (такими як хімічні речовини, ферменти та барвники). Той, хто переніс COVID-19 і вилікувався, також може показати хибнопозитивний результат.

Наскільки поширені хибнопозитивні результати?

Щоб зрозуміти, як часто трапляються помилкові спрацьовування, ми розглядаємо коефіцієнт помилково позитивних результатів: частка людей, які пройшли тестування, які не мають інфекції, але повертають позитивний тест.

Автори недавнього передрук (стаття, яка ще не була рецензована або незалежно перевірена іншими дослідниками), провела огляд доказів хибнопозитивних показників для тесту RT-PCR, що використовується для виявлення ГРВІ-CoV-2.

Вони об'єднали результати численних досліджень (деякі розглядали ПЛР-тестування на SARS-CoV-2, а деякі - ПЛР-тестування на інші РНК-віруси). Вони виявили хибнопозитивні показники 0-16.7%, у 50% досліджень - 0.8-4.0%.

Помилкові позитивні показники в систематичному огляді в основному базувались на тестуванні забезпечення якості в лабораторіях. Ймовірно, що в реальних ситуаціях точність гірша, ніж у лабораторних дослідженнях.

A систематичний огляд дивлячись на показники хибнонегативних негативних результатів при тестуванні ПТ-ПЛР на ГРВІ-CoV-2, виявлено, що показники хибнонегативних негативних результатів становили 1.8-58%. Однак вони зазначають, що багато досліджень були неякісними, і ці результати базуються на низькоякісних доказах.

Жоден тест не є ідеальним

Скажімо, наприклад, реальний показник хибнопозитивних результатів становить 4% для тестування на ПАР-ПЛР на SARS-CoV-2.

На кожні 100,000 4,000 людей, які пробують негативний результат і справді не мають інфекції, ми очікуємо, що ми матимемо XNUMX помилково спрацьованих результатів. Проблема в тому, що для більшості з них ми ніколи про них не знаємо. Людину, яка пройшла позитивний тест, просять поставити на карантин, і всі припускають, що мали безсимптомну хворобу.

Це також заважає той факт, що показник помилково позитивних показників залежить від основної поширеності захворювання. За дуже низької поширеності, як ми бачимо в Австралії, кількість помилкових спрацьовувань може в кінцевому підсумку набагато перевищувати фактичну справжню кількість позитивних результатів, що називається хибнопозитивний парадокс.

Через характер нинішнього спалаху Вікторії органи влади, ймовірно, пильно ставляться до результатів тестів, що потенційно робить більш імовірним підбирання помилкових спрацьовувань. Сказав уряд Вікторії:

Після аналізу експертною експертною комісією та повторного тестування у Вікторіанській референтній лабораторії інфекційних хвороб два випадки, пов’язані з цим спалахом захворювання, були визнані помилковими.

З цього не зрозуміло, чи були повторно протестовані двоє людей, чи просто повторно перевірені зразки.

У будь-якому випадку, не щастить мати два помилкових спрацьовування. Але з огляду на велику кількість людей, які щодня тестуються у штаті Вікторія, і той факт, що ми знаємо, що відбуватимуться помилкові спрацьовування, не є несподіваним.

Більш широкі наслідки

Для особи, яка отримала хибнопозитивний результат тесту, вони будуть змушені перейти на карантин, коли в цьому немає потреби. Якщо сказати, що у вас потенційно летальна хвороба, це дуже стресово, особливо для людей похилого віку або тих, хто перебуває в групі ризику через інші захворювання. Вони також, швидше за все, будуть стурбовані зараженням інших членів своєї сім'ї та можуть втратити роботу, перебуваючи в карантині.

Особливо дані органи влади спочатку вказали на ці два випадки як приклади передачі вірусу через "швидкоплинний" контакт, без сумніву, багато людей задавалися питанням, чи не було б без цих випадків Вікторія не заблокована. Це лише здогадки, і ми не можемо знати того чи іншого шляху.

Очевидно, помилково негативні результати дуже стурбовані, оскільки ми не хочемо, щоб інфекційні люди блукали по громаді. Але помилкові спрацьовування також можуть бути проблематичними.