Геномне дослідження грибів, що живуть на нашій шкірі, дає основу для розуміння того, як ці мікроби сприяють здоров’ю та хворобам шкіри.
Складні спільноти мікробів живуть на поверхні наших тіл. Ці грибки, бактерії та віруси спільно називають шкірним мікробіомом. Команда з Національного інституту досліджень геному людини (NHGRI) та Національного інституту раку (NCI) раніше використовувала геномні методи для вивчення шкірних бактерій. Вони знайшли різноманітні бактеріальні спільноти, які різнилися між людьми та за шкірою. У своєму новому дослідженні команда використовувала аналогічний геномний підхід, щоб краще зрозуміти гриби, які живуть на нашій шкірі.
До грибів належать форми, гриби та дріжджі, які використовуються для бродіння хліба та пива. Ці мікроби були пов’язані з багатьма шкірними захворюваннями та станами, включаючи інфекцію стопи спортсменів, екзему, лупу та нігті. Грибкові інфекції шкіри вражають приблизно 80 мільйонів людей у всьому світі. Але гриби можуть бути повільними і важкими для вирощування в лабораторіях, що робить грибкові інфекції важкими для виявлення та лікування.
в травні 22, 2013, вчені збирали зразки на сайтах тіла 14 у здорових дорослих 10. Вони зосередили увагу на фрагменті ДНК, який поділяли всі гриби - внутрішній транскрибований спейсер 1 (ITS1) рибосомної РНК - який можна було б використати для класифікації грибів на рівні роду з більшою точністю, ніж 97%.
Отримайте останні по електронній пошті
Генеруючи зразки більш ніж 5 мільйонів послідовностей ITS1, команда змогла ідентифікувати більше грибкових типів на рівні 80, що живуть на шкірі людини. На відміну від цього, традиційні методи культивування могли ідентифікувати лише типи 18. були виявлені на всіх ділянках шкіри. були переважаючим типом на 11 з сайтів 14, у тому числі за вухами, в ніздрях, на спині та на руках.
Команда виявила, що п’ятки, які не демонструють великого розмноження бактерій, були найскладнішим місцем грибів, де представлено близько 80 типів. Павутина ніг, приблизно з типами 60, і нігті нігтів, з 40, мали наступний найвищий рівень різноманітності грибів. Руки і руки, в яких є велика різноманітність бактерій, мали відносно мало видів грибів. Грибкові угруповання на основному тілі були досить стабільними з часом, з незначними змінами, коли тестувались до 3 місяців. На відміну від цього, гриби на стопах значно змінювались протягом 3 місяців, можливо, відображаючи більше впливу навколишнього середовища.
Грибні спільноти на людському тілі є складними та специфічними для сайту », - каже співавтор доктора Хайді Конг з NCI. Отримавши більш повне усвідомлення грибкових та бактеріальних екосистем, ми можемо краще вирішити супутні шкірні захворювання, включаючи грибкові інфекції, які можуть бути пов’язані з лікуванням раку.
Дані нашого дослідження дають нам основу про нормальних людей, яких у нас ніколи не було », - каже співавтор доктора Джулі Сегре з НГРПІ. Суть полягає в тому, що ваші ноги переповнені грибковою різноманітністю, тому надягайте шльопанці в роздягальні, якщо ви не хочете змішувати гриби на стопі з чужими грибами.
